Для території природного заповідника «Горгани» характерні наступні загрози природного характеру:
- Повені — значне затоплення місцевості внаслідок підйому рівня води в річці. Виникають під час тривалих злив та в результаті танення снігу.
- Снігові лавини - величезні маси снігу, які зсуваються зі стрімких гірських схилів, захоплюючи різні об'єкти, що трапляються на шляху.
© Глистюк Юрій
- Зсуви – це зміщення вниз по косій під дією сил тяжіння великих ґрунтових мас, що формують гірські схили, а також схили річкових, озерних та морських терас.
© Драгун Х.Р.
- Шторми - тривалий, дуже сильний вітер, що спричиняє значні руйнування на суші.
- Урагани - вітер руйнівної сили зі швидкістю 35 м/с.
- Бурі - шторм, тривалий, дуже сильний вітер (понад 20 м/с), спричинений зазвичай циклоном.
- Сильні снігопади і заметілі - випадання великої кількості снігу за короткий час. Внаслідок сильних снігопадів утворюються снігові заноси.
- Заморозки - короткочасні зниження температури повітря чи поверхні ґрунту до мінусових значень вночі чи вранці за переважно плюсових значень температури протягом доби.
- Ожеледі - намерзання переохолоджених крапель дощу або туману на земній поверхні або на предметах.
- Сель – раптово сформований внаслідок різкого підйому води в руслах гірських річок, грязьовий потік. Причинами виникнення селевих потоків майже завжди бувають сильні зливи, інтенсивне танення снігу та льоду.
Для території природного заповідника «Горгани» можливі наступні загрози антропогенного характеру:
- Джипінг - перегони, ралі, трофі-рейди та інші заходи на важкопрохідній техніці по природних територіях (автомобілі, багі, квадроцикли). Джипінг заборонений на території об'єктів природно-заповідного фонду низкою нормативних актів.